مطالعه کنفورمرهای مختلف دی پپتید محافظت شده hco-gly-l-leu-nh2 با استفاده از محاسبات کوانتومی

چکیده : در این تحقیق ، کنفورماسیون های مختلف دی پپتید hco-gly-l-leu-nh2 در اثر چرخش زنجیر های جانبی و زوایای پیچشی اسکلت ، در فاز گازی مورد بررسی قرار گرفته است . محاسبات با استفاده از برنامه گوسین 2003 در سطح hfبا سری پایه 6-31g*و6-311++g** و در سطح b3lyp با سری پایه 6-31g* انجام شده است. در ابتدا از چرخش زاویه زنجیره جانبی (?1) ، به فواصل?30 از صفر تا ?360 درجه ساختار های بهینه و انرژی محاسبه شدند که سه مینیمم در180 ?1= ، 60?1= و 270 ?1= به دست آمد. سپس زاویه (?1) در این سه حالت ثابت و زاویه (?2) را به فواصل?30 از صفر تا ? 360 درجه چرخانده و ساختار های بهینه و انرژی محاسبه شدند که سه مینیمم در (180, ?1= 180 (?2= ? (60, ?1= 210 ?2= ) و (270, ?1= 300 ( ?2= به دست آمد شدند . سپس برای پایدارترین حالت (aa) ، زوایای پیچشی اسکلت ساختار های بهینه ، انرژی و مقادیر ترمودینامیکی انرژی آزاد گیبس ، آنتالپی و آنتروپی در فواصل ? 30 از صفر تا? 360 درجه محاسبه شدند . در پایدارترین حالت زوایای پیچشی180 , ?1=180 = , ?1 210 = ?2 , 150 ?2=یافت شدند . انرژی و توابع ترمودینامیکی طبق نقشه راماچاندران در حالت aa زنجیره ی جانبی در سطح hf و b3lyp و mp2 با سری پایه 6-31g* محاسبه شد که کنفومر?l?l در هر سه سطح به عنوان پایدارترین کنفومر یافت شد .